Den dödliga virussjukdomen antogs vara utrotad från huvudstaden då inga nya insjuknanden rapporterats de senaste tre veckorna. Men de senaste dagarna har nya fall upptäckts, enligt nyhetsbyrån Reuters.
Den värst kända ebolaepidemin hittills beräknas ha dödat över 11 000 människor i Västafrika, varav ungefär en tredjedel i Sierra Leone. Liberia blev ebolafritt i maj, men grannländerna Sierra Leone och Guinea kämpar fortfarande för att utrota sjukdomen.
Att nya fall nu upptäckts i Sierra Leones huvudstad oroar landets hälsomyndigheter eftersom myndigheterna stängt karantänerna i staden.
Nu finns en uppenbar risk att sjukdomen får spridning igen eftersom de nya fallen upptäckts i ett fattigt tättbefolkat område utan tillräckliga hygienutrymmen.